O CLE, planejado e organizado em 1976, foi oficialmente instituído na UNICAMP em 1977 pelo professor Oswaldo Porchat Pereira, tendo como membros professores e pesquisadores de diversos Institutos da UNICAMP e de outras universidades brasileiras e estrangeiras.
Criado com o objetivo principal de desenvolver atividades na área de Lógica, Epistemologia e História da Ciência, bem como pesquisas interdisciplinares, o CLE mantém intenso intercâmbio acadêmico com pesquisadores e instituições brasileiras e estrangeiras; organiza regularmente seminários e reuniões científicas; coordena trabalhos de pesquisa; assessora cursos de pós-graduação interdisciplinares; cuida de um acervus bibliográfico e documental e promove a publicação de duas revistas e de uma coleção de livros.