A concepção e a implantação desse Observatório foram parte integrante das atividades desenvolvidas no âmbito do Projeto Temático FAPESP "Sistêmica, Auto-Organização e Informação" (proc. 2011/52627-9), no período 2011-2017. Para tanto foi utilizado o Sistema de Ensino a Distância TelEduc (Curso: Seminários de Auto-Organização) com acesso restrito aos participantes regulares cadastrados no Grupo CLE - Auto-Organização.

Atualmente está se efetivando a implementação do Observatório com a sua reorganização adaptada ao espaço virtual no sítio do CLE acima indicado, com acesso pela rede sem restrição a qualquer interessado.

O objetivo desse Observatório é difundir as informações concernentes aos trabalhos produzidos pelo grupo CLE Auto-Organização e às várias linhas de pesquisas: Auto–Organização e Ciência Cognitiva, Auto–Organização e Ciência dos Sistemas, Auto–Organização e Ciências da Vida, Auto–Organização e Processos Criativos, e Auto–Organização e Big Data. Ao mesmo tempo o Observatório propicia a manutenção de arquivos para a disponibilização de resultados produzidos durante a evolução dessas linhas de pesquisa.

Assim sendo, o Observatório Auto-Organização constitui um "ponto de encontro" de observação e "intervenção na realidade", pressupondo uma multiplicidade de pontos de vista e a existência de um espaço privilegiado no qual possam ser expressados.